民進黨黨主席登記補選最後一天，民進黨中生代以新潮流派系為首的桃園市長鄭文燦，和準台南市長黃偉哲、屏東縣長潘孟安、及英系前立委陳其邁、正國會台中市長林佳龍、新竹市長林智堅、準嘉義縣長翁章梁等人，共推屬於謝系的行政院秘書長卓榮泰參選黨主席。
鄭文燦表示這次共推卓榮泰參選黨主席，一開始是因為要約陳其邁一起喝咖啡，後來大家上台北見個面聊了一下，隨後便決定共推卓榮泰，他強調這是他們黨內年輕一輩的想法與決定，並不是如外傳在總統官邸喬出來的人選，更非其他因素，對此卓榮泰笑說，你看他們堅定的表情，是讓人無法拒絕的。
對於參選黨主席，卓榮泰表示現在最重要的不是民進黨需要什麼樣的黨主席，而是台灣需要什麼樣的執政黨，卓榮泰更說民進黨欠台灣人民一個承諾，這個承諾就是推出好的政策，讓台灣人民過好的生活，就這麼簡單，他接著表示未來他也不排除到台灣各地去了解民情，希望他所帶領的民進黨能讓人民看到改變，他誓言要讓民進黨成為「三實政黨」，即誠實、務實、踏實的政黨，也要將民進黨變成服務型的政黨。但外界也認為卓榮泰屬於謝系，而謝系處於式微階段，加上卓榮泰在黨內較無野心，因此他為各派系能接受的角色，對此卓榮泰表示既然大家要做黨的改革與檢討，如果再從派系來論事的話，就表示黨內的檢討沒有成功，甚至根本還沒開始。
只是卓榮泰參選黨主席，表面上是各派系共推，但民進黨內各派系仍有異音。九合一甫敗選之際，立委段宜康在立法院跳出來對行政院長賴清德發難，要中央面對改革過程中的錯誤，並對政府在公投案中的立場表述完全噤聲，他大表不滿，當時卓榮泰為賴清德抱屈，批評段宜康強烈主導黨團，卻一點都不檢討自己，很難接受如此的質詢。就此段宜康與卓榮泰之間似有芥蒂，對此卓榮泰表示他是就事論事，沒有任何針對性，相信段宜康能明白他的意思。
不過，新潮流創流大老吳乃仁卻還是退黨抗議，他表示無法認同同屬新系的鄭文燦，在段宜康與卓榮泰的事件不到一個月，就推舉卓榮泰參選黨主席，對此卓榮泰表示吳乃仁是黨內和藹可親的大老，希望他留下，繼續帶領大家把黨的改造繼續完成。段宜康隨後更在臉書上直指，卓榮泰不是鄭文燦找出來的。卓榮泰在11月27號的那番話，也是當天中午一場便當會的産物，卓榮泰只是傳達雷霆之怒的管道。卓榮泰的資歷和見識，不比鄭麗君、林佳龍、陳其邁差；雖然他是已經為敗選請辭的洪耀福秘書長的副手，是已經宣示將因為敗選而離職的賴清德院長的幕僚長；但如果都以這個標準要求，民進黨菁英將無人可用。
